Cartografierea Moștenirii Puerto Rico Cu Spit Și Genomică

{h1}

Strămoșii mixte ai purtașilor apar în genomul lor, iar studenții locali colectează scuipat din întreaga insulă pentru a descrie această istorie folosind markeri genetici.

Când a venit momentul ca studenții să aleagă gene care să studieze de la genomii colegilor lor portoricani, Alexandra Wiscovitch i-a ales pe cei responsabili de culoarea părului și a ochilor. În calitate de profesor de modelling, ea observase că elevii ei aveau o varietate de amândoi.

„Vă gândiți la purtașicani și vă gândiți la noi toți având culoarea ochilor căprui și culoarea părului maro”, a spus Wiscovitch.

Interesul studentului Jorge Irizarry Caro în studiul medicinei, în special cardiologia, l-a ajutat să selecteze o genă care poate juca un rol în atacul de cord.

Wiscovitch și Caro sunt printre cercetătorii studenți care cartografiează moștenirea genetică a Puerto Rico, pe baza ADN-ului (acid dezoxiribonucleic) în probe de scuipat pe care le-au colectat de la localnicii de pe plaje, din centrele comerciale și din alte locuri publice de pe insula.

Materialul genetic pe care îl colectează conține indicii despre strămoșii din Puerto Rico - un amestec de indieni africani, europeni și americani - susceptibilitatea la boli și proeminența altor trăsături, cum ar fi culoarea părului și a ochilor. [8 Fapte surprinzătoare despre sănătatea hispanilor]

"Acesta este obiectivul spre care ne îndreptăm, să descrie diversitatea genetică de pe întreaga insulă și să o facem într-un fel de crowdsourcing, un studiu la un moment dat", a spus Taras Oleksyk, investigatorul principal al proiectului, Studii locale privind genomul diversității ( LGDS), la Universitatea Puerto Rico din Mayagüez. „Și sperăm că vom veni cu ceva pe imaginea de ansamblu”.

În calitate de genetician al populației, Oleksyk consideră că „cel mai interesant este modul în care diferiți oameni au venit în Puerto Rico și modul în care au adus diferite caractere genetice cu ei”.

Această „poveste a oamenilor” poate fi aplicată pentru a înțelege modul în care reacționează puportulienii la condițiile de mediu și riscurile de boală cu care se confruntă, a spus el.

Moștenire mixtă

Studenții își apropie obiectivul de a colecta 96 de probe din cele 78 de municipalități ale insulei. Yashira M. Afanador, un student absolvent, a început analiza care va duce la hărți detaliate ale modelelor de strămoși din Puerto Rico.

La sfârșit de săptămână și în timpul vacanțelor, studenții de la Universitatea din Puerto Rico din Mayagüez lucrează la colectarea de probe de scuipat de la 96 de persoane din cele 78 de municipalități ale insulei pentru proiectul local al studiului diversității genomului din Puerto Rico.

La sfârșit de săptămână și în timpul vacanțelor, studenții de la Universitatea din Puerto Rico din Mayagüez lucrează la colectarea de probe de scuipat de la 96 de persoane din cele 78 de municipalități ale insulei pentru proiectul local al studiului diversității genomului din Puerto Rico.

„Scopul nostru este să avem un eșantion mai reprezentativ din toată insula, pentru că toate studiile care au fost făcute, au fost făcute în probe foarte mici și împrăștiate pe insulă”, a spus Afanador.

Unul dintre aceste studii anterioare, publicat în PLOS ONE în 2011, a constatat că, în medie, strămoșii porto-ricanilor sunt 15% indieni americani (cunoscuți sub numele de Taino), 21% africani și aproape 64% europeni. Dar acest raport variază de-a lungul insulei, cu mai multe fonduri europene în partea de vest a insulei și mai mult african în partea de est.

În timp ce studiul a analizat markerii genetici moșteniți de la ambii părinți (numiți markeri autosomali), lucrările anterioare au folosit markeri moșteniți de la mamă pentru a găsi o pondere mult mai mare a strămoșilor de la Tainos. Acest rezultat reflectă probabil istoria imigranților bărbați care se căsătoresc cu femeile locale din Taino.

Când studenții se apropie de oameni, acești potențiali donatori sunt interesați în special de cercetarea patrimoniului puertorican.

„Toată lumea vrea să fie Taino”, a spus ea, referindu-se la indigenii care trăiesc pe insulă la sosirea europenilor. „Când colectăm probe, ei spun„ asta este strămoșul meu principal ”.

Medicamentul viitor

Proiectul LGDS poate ajuta, de asemenea, să explice de ce anumite boli, în special astmul, afectează mai mult decât alte populații mixte, cum ar fi mexicanii.

În cele din urmă, Caro vede proiectul ca o modalitate de îmbunătățire a asistenței medicale pentru purta-ricani prin medicina personalizată, „așa că, dacă mergeți la un spital, știu că sunteți predispuși la atacuri de cord din cauza strămoșii dumneavoastră genetice”, a spus el. [7 boli despre care poți afla despre un test genetic]

Cercetările lui Caro se concentrează asupra unei gene, cunoscută sub numele de LTA4H. S-a demonstrat că variante ale acestei gene cresc riscul de infarct miocardic (denumit în mod frecvent atac de cord) în rândul afro-americanilor. (Boala cardiovasculară a crescut în Puerto Rico și este acum a doua cea mai frecventă cauză de deces pe insulă, potrivit Caro.)

Caro a căutat variante specifice în LTA4H în eșantioane de la municipalități cu strămoșe africane ridicate și în altele cu strămoșe europene ridicate. El a descoperit că aceste variante au apărut într-adevăr la frecvențe ridicate în municipalitățile mai africane.

În cele din urmă, el intenționează să mapeze frecvența variantelor de pe insula.

Păr roșu ascuns?

Între timp, Wiscovitch a analizat gene asociate cu părul și culoarea ochilor, inclusiv o variație legată de părul roșu. În timp ce analiza mostre din partea de est a insulei, ea a găsit ceva surprinzător.

În timpul unui workshop, studenții de la Universitatea din Puerto Rico, la probele de genotip Mayaguez, folosind o nouă mașină de genom personal Ion Torrent la nou-înființatul centru genom din Caraibe. Aici, Jason Mitchell, un tehnician de la National Cancer Institute-Frederick lucrează cu studenți.

În timpul unui workshop, studenții de la Universitatea din Puerto Rico, la probele de genotip Mayaguez, folosind o nouă mașină de genom personal Ion Torrent la nou-înființatul centru genom din Caraibe. Aici, Jason Mitchell, un tehnician de la National Cancer Institute-Frederick lucrează cu studenți.

"În partea de est a Puerto Rico, unde există cea mai mare concentrare de africani, există și cea mai mare concentrație a părului roșu [varianta genelor]", a spus Wiscovitch. „Deci oamenii negri trebuie să aibă părul roșu acolo”.

Se așteptase să vadă mai mult din această variație genetică în anumite părți din Puerto Rico, cu mai multă strămoșeală europeană.

În toamnă, planifică cercetări de urmărire, care vor include informații despre culoarea părului participanților. Este posibil ca gena părului roșu să nu fie exprimată la persoanele care au părul întunecat, a speculat ea.

Munca continuă

Studenții continuă să colecteze eșantioane și să învețe cum să extragă ADN ca parte a LGDS, care este finanțată de Fundația Națională de Știință până în august. În cele din urmă, studenții își vor dezvolta propriile proiecte de cercetare, așa cum au făcut-o Caro și Wiscovitch și vor căuta finanțări externe pentru a le susține, a spus Oleksyk.

LGDS a ieșit din experiența lui Oleksyk luând studenți ușa în ușă cu colegul Juan Carlos Martinez-Cruzado în 2010 pentru a recruta participanți la Proiectul 1000 de genomi, care catalogează variații rare în multe populații. Acum, atât Oleksyk, cât și Martinez-Cruzado rulează LGDS.

Urmează-ne @wordssidekick, Facebook . Articol original pe WordsSideKick.com.






Descoperiri Științifice

Cercetare


Science News


„Familia” Strămoșilor Umani Nu Poate Fi Legată
„Familia” Strămoșilor Umani Nu Poate Fi Legată

Cele 8 Cele Mai Tari Locuri De Pe Pământ
Cele 8 Cele Mai Tari Locuri De Pe Pământ

Fizica Northern Lights Ar Putea Ajuta În Fuziunea Nucleară
Fizica Northern Lights Ar Putea Ajuta În Fuziunea Nucleară

Prins Pe Aparat De Fotografiat: Anemone De Mare Care Locuiesc Pe Gheață
Prins Pe Aparat De Fotografiat: Anemone De Mare Care Locuiesc Pe Gheață

5 Concepții Greșite Enorme Despre Extratereștri
5 Concepții Greșite Enorme Despre Extratereștri


RO.WordsSideKick.com
Toate Drepturile Rezervate!
Reproducerea Oricăror Materiale Permise Prostanovkoy Doar Link-Ul Activ La Site-Ul RO.WordsSideKick.com

© 2005–2020 RO.WordsSideKick.com