În Cadrul Științei Vieții: Ce Este O Ontologie?

{h1}

Bibliotecile virtuale pot ajuta cercetătorii biomedicali să împărtășească cunoștințe în continuă creștere, sugerează institutele naționale de sănătate.

Cercetătorii biomedicali se confruntă cu o problemă tot mai mare în încercarea de a-și gestiona cunoștințele. În timp ce oamenii de știință din diferite discipline, sau chiar doar în laboratoare diferite, efectuează experimente și fac schimb de informații, adună diferite tipuri de date și interpretează termenii în moduri diferite, uneori fără să-și dea seama.

Pentru a facilita biologii să înțeleagă datele și să împărtășească ceea ce știu, Institutele Naționale de Sănătate finanțează oamenii de știință pentru calculatoare pentru a construi biblioteci virtuale numite ontologii. Acestea organizează cunoștințe biologice folosind un limbaj universal.

Problema cu prea multe date

Imaginează-ți că ești un biolog care lucrează, să zicem, funcția creierului la pui. Înainte de a începe primul experiment, doriți să aflați ce cercetări s-au făcut pe creierul de pui.

Mai întâi căutați în literatura științifică - toate articolele din jurnal care au fost publicate în zona dvs. de interes. Apoi abordați bazele de date.

Dar chiar și atunci când analizați rezultatele, este posibil să nu le puteți interpreta sau compara. Căutarea dvs. în baza de date poate trage grafice din două studii cu coloane etichetate „lungimea ciocului”. Numerele puteau fi în medie, în milimetri, în centimetri, despre pui sau cocoși, orice. Dacă nu știți ce reprezintă numerele, datele sunt fără sens pentru dvs.

În plus, ceea ce numiți un pui poate să nu fie ceea ce un alt cercetător numește un pui. Aceasta este o problemă răsunătoare în cercetarea genelor, în care diferiți oameni de știință apelează aceleași segmente ADN cu nume diferite sau folosesc aceleași nume pentru a se referi la segmente diferite. Dacă nu vă dați seama că datele doctorului Smith despre ceea ce el numește un pui sunt de fapt despre ceea ce ați numi un elefant, „puteți veni cu câteva concluzii cu adevărat interesante, dar nefavorabile”, spune Karin Remington, care conduce Centrul pentru Bioinformatică și biologie computerizată la Institutele Naționale de Sănătate.

Ontologii la salvare

Prin stabilirea unui set de termeni oficiali, ontologiile permit biologilor din laboratoare, specialități și țări să împărtășească un vocabular comun. Ontologia Web Language, o alegere populară, dă fiecărei proteine, fiecărei gene, fiecărui proces biologic, un nume standard. Toată lumea va numi acea creatură ploioasă, cu pene, care se transformă într-un „pui”, iar termenul nu va fi folosit pentru a descrie altceva.

De asemenea, o ontologie stabilește ce știu biologii despre obiectele pe care le studiază. De exemplu, un pui:

  • Este un animal domesticit folosit pentru alimente.
  • Pune ouă dacă este de sex feminin.
  • Nu se poate zbura pe distanțe lungi.

În același mod, o genă particulară poate fi marcată ca „face proteine ​​care întăresc peretele celular” sau „localizată pe cromozomul 2.”

Un alt beneficiu este faptul că ontologiile organizează termeni pentru a arăta modul în care obiectele și conceptele se raportează între ele. Ontologii pot descrie aceste asociații ca un arbore, o diagramă de fluxuri sau structura de folder cuibărită pe computer. Aceste imagini fac mai ușor de înțeles că un pui este un fel de pasăre și cerebelul face parte din creier.

Provocări care urmează

Pe măsură ce ontologii împletesc toate aceste cunoștințe științifice în categorii ordonate, trebuie să ștergă obstacole majore. De exemplu, cercetătorii nu sunt întotdeauna de acord cu terminologia. De asemenea, nu au în mod necesar aceeași părere despre funcția unei proteine ​​sau legăturile dintre anumite gene și bolile umane. Aceste roluri nu sunt întotdeauna clare, mai ales la marginea descoperirii. De fapt, sociologia construirii ontologiei - cum să obținem comunitățile să se dezvolte și să se pună de acord asupra standardelor - este una dintre cele mai provocatoare și răsplătitoare domenii de cercetare, spune Peter Lyster, de asemenea, al Centrului NIH pentru Bioinformatică și Biologie Computațională.

Probabil că nu va exista niciodată o singură ontologie, incontestabilă, care să conțină toate cunoștințele științifice. Dar acesta nu este obiectivul, spune Lyster. În schimb, este să dezvolți o serie de ontologii care sunt utile oamenilor de știință din domenii specializate și care sunt indexate într-un singur loc. De asemenea, este de a convinge oamenii de știință din întreaga lume că a avea aceste ontologii nu este numai util, ci este esențial.

Aflați mai multe:

  • Centrul Național de Ontologie Biomedicală
  • Viața de calcul: modul în care instrumentele de calcul avansează sănătatea și biologia

Acest articol Inside Life Science a fost furnizat WordsSideKick.com în colaborare cu Institutul Național de Științe Medicale Generale, parte a Institutelor Naționale de Sănătate.






Descoperiri Științifice

Cercetare


Science News


Furtuna Tropicală Se Formează Gilma În Pacificul De Est
Furtuna Tropicală Se Formează Gilma În Pacificul De Est

Under Sea: A Squid Album
Under Sea: A Squid Album

Revizuirea Căutării Instantanee Google: Mai Rapid (Uneori)
Revizuirea Căutării Instantanee Google: Mai Rapid (Uneori)

Date Despre Argint
Date Despre Argint

Am Verificat De Fapt Știința Din Spatele Platformei Partidului Republican
Am Verificat De Fapt Știința Din Spatele Platformei Partidului Republican


RO.WordsSideKick.com
Toate Drepturile Rezervate!
Reproducerea Oricăror Materiale Permise Prostanovkoy Doar Link-Ul Activ La Site-Ul RO.WordsSideKick.com

© 2005–2020 RO.WordsSideKick.com